Samurai Jack se inicia no passado onde o mestre das trevas chamado Abu, causou muita destruição e sofrimento para a humanidade na época, mas uma família de grandes guerreiros que possui uma espada mágica, a única arma que pode deter Abu. Após uma épica batalha entre o imperador e Abu, este é aprisionado pelo poder da espada. Muitos anos se passaram e Abu conseguiu se libertar e voltou para se vingar do imperador e levar destruição para o mundo novamente. Mas enquanto Abu toma o poder, o filho do imperador "Jack" está aprendendo artes marciais e novas habilidades de luta em várias partes do mundo e é o único que pode usar a espada mágica para aprisionar Abu novamente.
Episódio 01 - Samurai versus Ninja
Episódio 02 - Robo Samurai versus Mondo Bot
Episódio 03 - Samurai versus Samurai
Episódio 04 - The Aku Infection
Episódio 05 - The Princess and the Bounty Hunters
Episódio 06 - Scotsman Saves Jack Parte 1
Episódio 07 - Scotsman Saves Jack Parte 2
Episódio 08 - Jack And The Flying Prince And Princess
Episódio 09 - Jack versus Aku
Episódio 10 - The 4 Seasons of Death
Episódio 11 - Tale of X9
Episódio 12 - Young Jack in Africa
Episódio 13 - Jack and the Baby